HLAB27与强直性脊柱炎有一定联系，但不能仅凭该指标确诊强直性脊柱炎。既然强直性脊柱炎是脊柱关节病的一种，那么可以通过检测HLAB27诊断脊柱关节病吗?
脊柱关节病SpA是指以中轴、外周关节及关节周围组织慢性进展性炎症为主要表现的一组疾病，本组疾病以强直性脊柱炎为原型，目前已被认识或确定的诊断包括：强直性脊柱炎、反应性关节炎ReA、银屑病关节炎PsA、炎症性肠病关节炎IBDA、幼年型脊柱关节病JSpA及未分化脊柱关节病uSpA等。
大多数SpA患者携带HLAB27基因，是其中的脊柱或骶髂关节的受累与HLAB27关系更为密切，尽管HLAB27与SpA密切相关，但并不能作为确诊依据，它仍只是临床诊断或判断预后的一个参考。
SpA中各疾病分类的HLAB27携带率并不完全相同：约90%强直性脊柱炎患者HLAB27阳性，70%以上ReA患者HLAB27阳性，80%JSpA，50%伴脊柱关节受累的银屑病或肠病相关的关节炎患者为HLAB27阳性。
此外，关于HLAB27基因的遗传问题，HLAB27基因有50%的机会遗传给子女，而对于HLAB27阳性的子女则有20%的可能会罹患SpA，但HLAB27阴性的子女罹患SpA的可能性极小。再者，HLAB27阳性可其亲属有罹患本组疾病的可能，往往能使潜在患病者得到早诊断、早治疗。
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