分流手术是治疗脑积水的主要方法，分流手术的风险是感染，病人可能会出现高烧、头痛等症状。
为了判断是否有细菌或病毒感染倾向，需要进行一系列的检查，如血常规检查、脑脊液化验等。
如有感染，常规治疗是将分流管重新取出，进行外部引流，连接到无菌袋中，然后将脑脊液引流出来。
由于分流手术时间较长，还会出现管道不够长或管道移位的情况，出现情况要对症治疗，要把分流管还回去。
脑积水患者可脑脊液脑室腹腔分流手术，需要将分流管装置植入人体，一端放置在脑脊液室，另一端放置在腹腔，多余的脑脊液通过分流管装置流入腹腔吸收。
由于人体脑脊液不断产生，成年人每天大脑中大约会产生500毫升的脑脊液。脑积水患者脑脊液分泌与吸收的平衡被打破，多余的脑脊液需要不断引流。植入分流管装置引流多余的脑脊液后是不可能解决问题的，因为脑脊液会不断产生。分流管一旦植入，如果没有感染或皮肤破裂等意外情况，分流管需要终身留在患者体内。
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