低位肛瘘内口无精确值，一般在35cm以内。
低位肛瘘是指肛瘘管或创腔位于肛门外括约肌深层以下的肛瘘。该病可发生在各种年龄段和不同性别。它在中青年中更为常见，男性比女性多。近年来，儿童的发病率逐年上升。由于肛周局部特殊的解剖生理环境，如果肛瘘发生后不及时治疗，往往会导致肛周感染、肿胀、疼痛和疤痕。
低位肛瘘包括低位单纯肛瘘和低位复杂肛瘘。低位单纯肛瘘只有一个瘘管，通过外括约肌深部以下，内口靠近肛窦。低位复杂肛瘘包括括约肌深部以下，外口和瘘管超过两个，内口一个或多个在肛窦。
一般建议手术治疗。手术治疗的目的是打开瘘管，使其排水顺畅，伤口逐渐康复。手术成功的关键是正确找到内口，然后切开或切除内口。
临床上，高低肛瘘的主要临床症状一般仍发生在外口，会间歇性引起肿胀、疼痛、溃疡、脓液，引起肛周皮肤潮湿瘙痒。而且长期发病会引起肛周皮肤炎症或苔藓样变化，引起肛周湿疹或神经性皮炎。
此外，如果高肛瘘，由于瘘管不受括约肌控制，粪便和气体会从外口排出，污染内衣。除上述症状外，高低肛瘘还可能引起排便异常，如排便困难，有时还会引起排便失禁等。
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